Reanálisis de estructura poblacional y diversidad genómica entre dos Especies de aves de la costa oeste de norteamérica

Abstract

La genomica para la conservación es considerada como una herramienta emergente en la evaluación de la estructura poblacional de las especies. Sin embargo, la interpretación de estos resultados (estructura poblacional) están condicionados por el tipo de metodologías aplicadas a muestreos, secuenciación de genomas y tratamiento de matrices SNPs, y debido a que son técnicas nuevas, aún no se han establecido estándares para muchos de estos pasos. Con esta premisa, este estudio propone el reanálisis de las poblaciones de 2 especies de aves, Strix nebulosa (5 poblaciones) y Falco mexicanus (4 poblaciones), para evaluar el efecto de submuestreos poblacionales e individuales en las estimaciones de estructura poblacional, inferencias de 'admixture' y de varias medidas de heterocigosidad, todas cruciales para evaluar el estado de conservación de una especie así como su manejo. Ambas especies han sido previamente evaluadas con sus respectivas bases de datos en el repositorio digital Dryad. A pesar de compartir características ecológicas, distribución y estado de conservación, poseen diferencias en su diversidad genética relacionado al aislamiento geográfico por parte de los búhos y altos niveles de admixture en el caso de los halcones (población panmitica). El presente reanálisis tuvo como objetivo identificar posibles sensibilidades estadísticas al evaluar los submuestreos de ambas especies utilizando filtros como la exclusión de poblaciones y de individuos en las matrices de SNPs. Utilizando los paquetes de análisis bioestadístico adegenet y diversidad genética hierfstat en el software R se obtuvieron nuevos sets de resultados para cada submuestreo aplicado. Estos resultados demostraron susceptibilidades bioestadísticas en las condiciones de submuestreo evaluadas. Las diferencias con los estudios previos sugieren que la representación de sus estructuras poblacionales son influenciadas por el grado de divergencia genética entre sus poblaciones. Las nuevas características genéticas no descritas previamente mejoran la resolución de las estructuras poblacionales de las especies de interés ampliando herramientas para la conservación de las especies.